HLAといえば骨髄移植を想像する方も多いだろう。骨髄移植では5座（A, B, C, DRB1, DQ, DP）を合わせる(DPを合わせるのは難しい為、permissive mismatchを許すこともあるそうだ)。また、些細なアミノ酸配列の違いもGVHDの元になるため、高解像度の解析で2nd fieldまで合わせなければならない。
いっぽう固形臓器移植（solid organ transplant）ではserotypeしか合わせないので低解像度の解析でよさそうなものであるが、近年は高解像度の解析をするようになった。些細なアミンさん配列の違いが、エピトープ解析などに役立つためだ。
